for income that is not taxable in Canada under a tax treaty, do not report that income, or any tax withheld from it, in your foreign tax credit calculation.
Ну, я вот не могу уверенно утверждать, что это ничего страшного.
Вообще ситуация когда “ой забыл указать, потом просто доплачу” мне кажется совсем не поощряется. Иначе бы никто налоги вообще не платил, пока не прийдут с проверкой.